和布克赛尔县辖2个镇、6个乡、3个牧场。县境内有新疆生产建设兵团农十师一八四团场（共六个连队）、农十师煤矿、一三七团场煤矿等9个驻县单位。 

和布克赛尔镇地处和布克赛尔县境北部谷地中央，是和布克赛尔县人民政府驻地，成立于1977年。总面积36平方公里，辖84个驻镇单位、3个社区和1个镇卫生院，由蒙古、汉、哈萨克、维吾尔、柯尔克孜等17个民族组成。 

和什托洛盖镇是和布克赛尔县的南大门，距县城45公里，总面积约6684平方公里，辖9个行政村，4个社区，4所学校，有厂矿企业、站所及驻镇单位49个，由蒙古、汉、哈萨克、维吾尔等13个民族组成。地理位置优越，交通便利，矿产资源丰富，企业云集。2004年和什托洛盖镇被列为全国1887家、自治区26家重点建设小城镇。 

夏孜盖乡位于县城东南70公里，总面积9935平方公里。境内驻有兵团农十师184团农场，空九军雷达站，新疆石油管理局夏孜盖油田指挥部。辖11个行政村。夏孜盖是蒙古语，意为喜鹊地或喜鹊，二百多年前，因此地茂密的树林中栖息着成群的喜鹊而得名。 

莫特格乡位于县城以东2公里处，总面积1050平方公里，辖8个行政村，由蒙古、汉、哈萨克、维吾尔等13个民族组成。莫特格是蒙古语，意为脚尖。1639年为准噶尔汗国的大本营，1772年土尔扈特一部在此居住，建莫特格村，1984年更名为莫特格乡。 

查干库勒乡位于县城东部18公里处，总面积1750平方公里，辖13个行政村，主要由蒙古、汉、哈萨克、维吾尔等4个民族组成。 

巴音傲瓦乡位于县城以东30公里处，总面积约190平方公里。辖6个行政村，哈萨克族占总人口的98.32%，是和布克赛尔县唯一的哈萨克民族乡。

铁布肯乌散乡位于县城西北30公里处，总面积3462平方公里，共有8个行政村，由蒙古、汉、哈萨克、回、塔塔尔、维吾尔等6个民族组成。 

布斯屯格牧场位于县城以东42公里处，总面积3502平方公里，辖4个自然村，由蒙古、哈萨克、柯尔克孜、维吾尔、汉等5个民族组成。 

伊克乌图布拉格牧场位于县城以东60公里处，总面积2541平方公里，辖1个农业村，4个牧业村，由蒙古、汉、哈萨克、回、维吾尔等5个民族组成。 

巴嘎乌图布拉格牧场位于县城以东51公里，总面积2953平方公里，辖2个行政村、2个牧业村，1个煤矿，由蒙古、汉、哈萨克3个民族组成。 

查和特乡行政区域面积94.73平方公里，位于准噶尔盆地腹地，离县城102公里，北距兵团农十师184团部（查干屯格镇）24公里。境内地势开阔，土地资源丰富，野生胡杨植被保护完好，有492万立方米调节水库一座，已开垦土地约12万亩，有4个社区。