和布克赛尔蒙古自治县位于准噶尔盆地西北边缘，地处塔城、克拉玛依、阿勒泰三地区中心，北与阿勒泰、哈萨克斯坦共和国交界，南部与玛纳斯县、沙湾县接壤，西南部以乌尔禾为界与克拉玛依市相连，西与额敏县、托里县以白杨河为界，东邻阿勒泰地区，东西最长210公里，南北最宽207公里，辖区总面积3.06万平方公里。

  和布克赛尔蒙古自治县历史悠久，早在秦汉时期就为塞种人、乌孙、匈奴等古民族的游牧地，西汉时期属乌孙国。东汉三国时期因西域天山南北诸国互相攻伐合并，县境归入车师后国。晋朝时为鲜卑辖地。南北朝时期（420～589)，先后属柔然汗国、突厥汗国和西突厥汗国。 唐显庆二年（657)，唐朝平定西突厥汗国，县境属唐昆陵都护府。贞元五年（789)，吐蕃联合葛逻禄，攻陷北庭都护府，县境为葛逻禄所有。唐元和三年（808)，回绝汗国统一天山南北，县境属回纥汗国。唐开成五年（840），回纥汗国崩溃，县境属黠戛斯汗国，不久，属喀喇汗王朝。宋建炎元年（1127），为西辽所辖。宋嘉定十一年（1218），归属成吉思汗的蒙元政权。宋宝庆元年（1225），封为成吉思汗三子窝阔台汗的领地，宪宗时归别失八里行省。元至十七年（1280），归阿力麻里行省。泰定帝时（1324～1328），归入察合台汗国。明太祖洪武三年（1370），归属察合台后裔建立的别失八里汗国。5世纪成为瓦剌的游牧地。明崇祯九年（1636），巴图尔浑继任台吉后，迅速统一了新疆北部地区的卫拉特各部，以霍博克赛里为大本营。崇祯十二至十六年（1639～1643），巴图尔浑台吉在今和布克赛尔县城东南5公里处修建城堡。清乾隆二十三年（1758），县境属清朝伊犁将军属下塔尔巴哈台参赞大臣管辖，乾隆三十六年（1771），从俄罗斯额济勒河（伏尔加河）南岸回归祖国的土尔扈特部进驻霍博克赛里。同年九月，乾隆封北部策伯克多尔济为和硕亲王，赐号布延图，称为北路乌讷恩素珠克图旧土尔扈特北路盟。民国4年（1915），在今和什托洛盖镇设县佐，隶属沙湾县。民国5年（1916）隶属塔城道。民国18年（1929），和什托洛盖县佐改称设治局。民国22年（1933），塔城道改行政区，和什托洛盖设治局隶属塔城行政区，民国30年（1941）改和什托洛盖设治局为和丰设治局，当时县境内分为北部的部族亲王政权和南部的政府政权。民国33年（1944），设治局为和丰县，迁至现今和布克赛尔镇。民国34年8月（1945），隶属“三区”政府塔城专区。新中国成立后，1950年4月，成立和丰县人民政府。1954年9月10日，成立和布克赛尔蒙古自治区（县级）。1955年2月，改称和布克赛尔蒙古自治县，隶属塔城专区。